一些制藥廢水直接采用好氧方法進行處理并不能收到好的效果，厭氧生物處理技術的引入，則大大地降低了在廢水處理方面工藝及技術難度，同時也減少了后續處理單元的費用，對生物制藥廢水的生物處理起到了極大的推動作用。表2是部分生物制藥廢水厭氧處理的情況。一般國內外對制藥廢水的終端治理都采用生物處理技術或物化加生物聯合處理技術。制藥廢水總體上看污染物以有機物為主，雖含有難降解有機物和抑制微生物生長的物質，但一般經適當的預處理和菌種馴化，用生物法處理可得到良好的處理效果。

　　由此可見，在加強管理的基礎上，采用適當的處理工藝，制藥工業的廢水污染去除率可達90%以上，技術上是可行的，也是應該做到的。從表3可以看出，國內的制藥廢水處理主要體現了以下特點：(1)制藥廢水的處理工藝多以厭氧一好氧組合為主要工藝路線，這也由制藥廢水濃度高、難降解的特點所決定的。(2)大部分制藥廢水在采用一般厭氧一好氧的聯合處理方法后都需進行一定的后處理才能達標排放。(3)厭氧一好氧組合工藝特點如下：1)水解酸化一好氧工藝，主要用于處理COD濃度在1000～4000mg/L以下的制藥廢水。工藝相對簡單，但好氧出水仍需一定的處理才能達標排放。2)厭氧消化(產甲烷)-好氧處理法主要用于處理COD濃度3000mg/L以上的制藥廢水，其中厭氧段可以承受很高的COD負荷，大幅降解COD，經過后續的好氧處理及后處理便可達標排放。

　　國內對高濃度抗生素有機廢水的處理處于工程實踐階段，目前已建成的以好氧工藝為主的工程，投資和處理成本高。高濃度的抗生素有機廢水經處理后，出水CODCr仍高達1000～4000mg/L，不能直接外排，還需要進一步處理，以保證達標排放。目前僅有一小部分抗生素廢水的治理取得了較為滿意的效果，大多數抗生素廢水仍難以治理。目前抗生素廢水的處理均需經過稀釋，大大增加了處理費用。由于廢水中的殘余抗生素和鹽類以及一些添加劑嚴重抑制厭氧微生物的正常代謝，且沒有一套成熟的方法較完全的提取抗生素殘渣，因此抗生素廢水的處理仍是一個難題。目前國內外對抗生素類工業廢水的處理主要采用厭氧、好氧或厭氧與好氧聯合工藝。抗生素種類繁多，因此各廠家生產的抗生素品種一般不同，廢水毒性也各異，因此針對某種抗生素生產廢水，研究、開發一些處理效果好，廠家經上能承數抗生素廢水的處理方法，具有重要的現實意義。